Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGA4P13612 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms