Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms