Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms