Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HKR1P10072 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HKR1P10072 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HKR1P10072 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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