Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOEP02649 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOEP02649 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOEP02649 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms