Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIOO75962 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIOO75962 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms