Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms