Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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