Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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