Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP9BO43861 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms