Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MTSS1O43312 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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