Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBDO15205 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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UBDO15205 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBDO15205 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBDO15205 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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