Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF879B4DU55 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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