Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms