Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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C4orf47A7E2U8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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