Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms