Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms