Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9Y3F1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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