Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms