Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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