Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms