Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGSF9Q9P2J2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms