Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms