Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KIAA1549Q9HCM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms