Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms