Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms