Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG1-210ENST00000484197 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001596.1-203ENST00000421771 1078 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00358-201ENST00000432697 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007728.2-202ENST00000567728 1150 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms