Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5Q99717 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms