Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VMP1Q96GC9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VMP1Q96GC9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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