Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms