Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZIC4Q8N9L1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZIC4Q8N9L1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms