Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms