Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC9Q8N567 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms