Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPAP2Q8IXW5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms