Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms