Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC141Q6ZP82 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC141Q6ZP82 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms