Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG16L1Q676U5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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