Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms