Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC93Q567U6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC93Q567U6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms