Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
INO80DQ53TQ3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms