Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms