Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL40Q2TBA0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms