Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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