Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLPPQ16740 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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