Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNAPC1Q16533 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNAPC1Q16533 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms