Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms