Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA2Q15822 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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