Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ALX1Q15699 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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