Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCEA2Q15560 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms