Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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SYCP1Q15431 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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